Дослідники з Каліфорнійського університету в Сан-Дієго створили комп’ютерну модель вірусу H1N1 в атомному масштабі. Він допомагає виявляти нові вразливості з урахуванням руху глікопротеїнів. Модель буде корисною для розробки вакцин проти грипу та противірусних препаратів.
Основними мішенями вакцини проти грипу є два поверхневі глікопротеїни — гемагглютинін (НА) та нейрамінідазу (NA). Тоді як білок НА допомагає вірусу зв’язуватися з клітиною господаря, NA діє як ножиці. Він відрізає HA від клітинної мембрани, що дозволяє вірусу реплікуватися. Хоча вченим уже відомі властивості обох глікопротеїнів, багато ще невідомо про їхній рух.
Вакцини проти грипу традиційно націлені на «головку» білка HA на основі нерухомих зображень. Вони виглядає щільним і малорухливим. Але нова модель показала динамічний характер HA та його «дихаюче» рух. Це дозволило вченим розкрити раніше невідому область імунної відповіді.
Отримані дані будуть корисними для того, щоб більше дізнатися про рух, зростання та еволюцію вірусу грипу і зрештою створити універсальну вакцину проти цього вірусу. «Нас в першу чергу цікавлять HA і NA, але є й інші білки, іонний канал M2, мембранні взаємодії, глікани і багато інших об’єктів і аспектів, що заслуговують на вивчення», — роблять висновок вчені.
